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赵秀娟

发布日期:2016-07-14   阅读:[]

赵秀娟女(19773月)

博士教授,硕士生导师

电话:0472-5951944

传真:0472-5951944

E-mailnmzxj1977@163.com

个人主页:暂无

l 教育经历

1996.09-2000.07 内蒙古大学生命科学学院学, 理学学士

2000.09-2003.07 内蒙古大学生命科学学院学习,理学硕士

2007.09-2011.70 内蒙古大学理学院物理系, 生物物理学博士

2013.09-2014.07清华大学生物系, 访问学者

l 工作经历

2003.7-2003.12 包头钢铁学院生物与化学工程系,助教

2004.1-2004.12 bv伟德国际体育生命科学学院,讲师

2005.1-2009.01 bv伟德国际体育生物与化学工程学院,副教授

2009.2-2016.02 bv伟德国际体育数理与生物工程学院,教授,系主任,硕士生导师

2016.3---今bevictor伟德,教授,硕士生导师

l 研究方向

开展生物信息学、表观遗传学等领域的研究,目前主要关注生物响应重金属胁迫的表观遗传学调控机制。近几年,结合地区经济发展,与本地企业共同开展工业菌种改良,固体发酵等相关研究。

l 科研成果获奖

1. 成果名称:相互作用网络及染色质结构水平遗传信息组织、传递规律的生物信息学研究,获奖等级:内蒙古自治区自然科学奖一等奖,2015.11

l 教学成果获奖

1. 成果名称:优化课程体系,狠抓队伍建设,以科学研究促进人才创新提升的探索与实践获奖等级:内蒙古自治区教学成果奖一等奖,2018.4,蔡禄、赵秀娟、巩东辉、杜志强、王晶妍

2. 成果名称:以课程体系建设促进生物技术专业创新人才培养的研究与实践,获奖等级:bv伟德国际体育教学成果奖一等奖,2015.11,蔡禄、赵秀娟、巩东辉、杜志强、王晶研、李珺

3. 成果名称:基础生物学验示范中心开放实验室的建设与管理,获奖等级:bv伟德国际体育教学成果奖二等奖,2011.11

4. 成果名称:生物技术专业实验课教学模式的探讨和研究,获奖等级:bv伟德国际体育教学成果奖二等奖,2011.11

5. 成果名称:本科生提前进入实验室参加科学研究的探讨,获奖等级:bv伟德国际体育教学成果奖二等奖,2009.8

l 科研项目

1. 国家自然科学基金面上项目,组蛋白乙酰化在酿酒酵母响应重金属镍胁迫中的调控作用(21767020),2018.1-2021.12

2. 国家自然科学基金面上项目,基于DNA序列、结构及表观遗传信息的酵母复制起始点的理论预测及实验研究(61361014),2014.1-2017.12

3. 内蒙古自然科学基金,组蛋白修饰调控重金属镉胁迫酿酒酵母的生物学效应(2019MS02021), 2019-2021

4. 内蒙古自然科学基金,组蛋白乙酰化对酵母Ⅲ号染色体复制起点的选择及起始活性的调控作用(2015MS0334), 2015-2017

5. 内蒙古高等学校科研基金,可变启动子的表观遗传学分析(NJZY12103),2012-2014

6. 内蒙古自然科学基金,酵母核小体定位对自主复制序列ARS活性的影响(2011MS0504),2011-2013

7. 教育部春晖计划,高通量测序法研究微生物基因组进化(Z2009-1-01054),2009

8. bv伟德国际体育创新基金,酵母核小体定位信号分析及应用(2009NC066),2009.1-2011.12

9. bv伟德国际体育创新基金,内蒙古盐生动物卤虫抗逆相关基因的研究(KJ200611),2005.1-2007.12

l 教研项目

1. 内蒙古自治区研究生公司产品改革研究与实践课题项目,产学研合作公司产品模式的研究与实践——以bv伟德国际体育生物学科为例(YJG20151012707), 2015-2017

2. bv伟德国际体育教学改革重点项目,新培养方案下生物化学与分子生物学教学团队的建设与实践,2014-2016

3. bv伟德国际体育教学改革重点项目,以课程体系建设推进生物技术专业创新人才培养(JY2011013),2012.1-2013.12

4. bv伟德国际体育教学(教改)研究,一般项目,生物技术专业实验课教学模式的探讨和研究(JY2009068),2009.10-2010.12

5. bv伟德国际体育校级精品课《分子生物学实验》负责人 2015

6. bv伟德国际体育校级优秀教学团队,工科生物化学与分子生物学团队负责人 2016

7. bv伟德国际体育

l 荣誉称号

1. 2005年,bv伟德国际体育“师德先进”个人

2. 2008年,bv伟德国际体育“优秀共产党员”

3. 2010年,bv伟德国际体育“团队建设与研究生教育先进”个人

4. 2010年,bv伟德国际体育“巾帼建功:先进个人

5. 2011年,bv伟德国际体育“优秀教师”奖

6. 2014年,bv伟德国际体育“巾帼建功:先进个人

7. 2014年,包头市“5512工程青年骨干

8. 2015年,内蒙古自治区321人才工程二层次人才

9. 2016年,bv伟德国际体育“优秀共产党员”

10. 2016年,内蒙古包头市优秀教师

11. 2017年,内蒙古自治区321人才工程一层次人才

12. 2019年,入选第九批自治区“草原英才”

l 代表性论著

SCI收录论文(*号为责任作者)

1. Guoqing Liu, Shuangjian Song, Qiguo Zhang, Biyu Dong, Yu Sun, Guojun LiuXiujuan ZhaoEpigenetic Marks and Variation of Sequence-Based Information Along Genomic Regions Are Predictive of Recombination Hot/Cold Spots in Saccharomyces cerevisiaeFrontiers in Genetics2021

2. Hongyu Zhao, Fenghui Zhang, Mingxin Guo, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao & Lu Cai . The affinity of DNA sequences containing R5Y5 motif and TA repeats with 10.5-bp periodicity to histone octamer in vitro, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2019, 37(8):1935-1943.(SCI, IF3.31)

3. Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Tao Yu, Dong Liang, Jun Li, Guanyun Wei, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hongyu Zhao, Lu Cai*, MiasDB: A Database of Molecular Interactions Associated with Alternative Splicing of Human Pre-mRNAs. Plos One, 2016, 11(5): e0155443. (SCI, IF3.234)

4. Xiang-Jun CuiLu Cai, Yong-Qiang Xing, Xiu-Juan Zhao, Chen-Xia ShiInfluence factors on the correlations between expression levels of neighboring pattern genes. Biosystem, 2016, 139:23-28. (SCI, IF1.784)

5. Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Ping Chen, Xiujuan Zhao, Guohong Li*, Lu Cai*. GAA triplet-repeats cause nucleosome depletion in the human genome. Genomics, 2015, 106:88-95 (SCI, IF3.32)

6. G-Q Liu* F Feng X-J Zhao and L Cai*, Nucleosome Organization around Pseudogenes in the Human GenomeHindawi Publishing Corporation. BioMed Research International 2015, Article ID 821596 (SCI IF1.579)

7. Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao and Lu Cai*, Genome-wide characterization and prediction of Arabidopsis thaliana replication origins. Biosystem 2014, 124:1-6 (SCI, IF1.784)

8. Yong-qiang Xing &Guo-qing Liu &Xiu-juan Zhao &Lu Cai*An analysis and prediction of nucleosome positioning based on information content. Chromosome Res. (2013) 21:63–74 (SCI, IF3.23)

9. Yongqiang Xing Xiujuan Zhao and Lu Cai*, Prediction of nucleosome occupancy in Saccharomyces cerevisiae using position-correlation scoring function. Genomics (2011) 98:359-366 (SCI, IF3.32)

10. Xiujuan Zhao Zhiyong Pei Jia Liu and Lu Cai*, Prediction of Nucleosome DNA Formation Potential and Nucleosome Positioning Using Increment of Diversity Combined with Quadratic Discriminant Analysis, Chromosome Res. (2010) 18:777-785 (SCI, IF 3.23)

11. Xiujuan Zhao, Zhiyong Pei, Jia Liu, Sheng Qin, SongyeRen , Lu Cai* Nucleosome Positioning Prediction in C. elegans Based on Increment of Diversity combined with quadratic discriminant analysis. The 3rd International Conference on Advanced Computer Theory and Engineering (ICACTE 2010) V1-266-268 (EIISTP)

12. Lu Cai, Jia Liu and Xiujuan Zhao, Protein-Protein Interaction Prediction Using Increment of Diversity Combined with Quadratic Discriminant Analysis. The 2010 International Congress on Computer Applications and Computational Science (CACS 2010), December 2010, Singapore (EI)

13. 郭艳飞,黄勇霖,张苗苗,蔡禄,赵秀娟*,高浓度氯化镍胁迫下酿酒酵母组蛋白H4K5去乙酰化调控金属硫蛋白基因的表达,应用与环境生物学报. 2020, 26(3):551-557.

14. 边金,郭艳飞,张治,张淑慧,赵秀娟*,组蛋白修饰对酿酒酵母复制起始相关蛋白基因表达的调控,基因组学与应用生物学,2019,38(6):2596-2602.

15. 边金,郭艳飞,张治,张淑慧,赵秀娟*,重金属镍胁迫下酿酒酵母实时荧光定量PCR内参基因的筛选,bv伟德国际体育学报,2018,321):11-14,75.

16. 薛涛涛,边金,伍陆,赵秀娟*,崔向军,蔡禄. 酿酒酵母组蛋白H3K56A突变菌株的构建及其对细胞生长的影响. 江苏农业科学,2016,44(12):77-81.

17. 邢永强赵宏宇刘国庆赵秀娟蔡禄. 裂殖酵母复制起始位点的序列特征分析和预测.生物物理学报,2014,30(6):463-472.

18. 赵秀娟 郑晓东 薛涛涛 蔡 禄. 酿酒酵母YPH499Ⅲ号染色体上ARS形成核小体能力的比较, 中国生物工程杂志, 2014,34(11):39-46.

19. 郑晓东,赵秀娟*,蔡 禄,王建英. α因子调控酿酒酵母细胞同步化, 河南师范大学学报(自然科学版),2014,42(2):131-136.

20. 陈冰任松叶赵秀娟*蔡禄. 原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测,信阳师范学院学报,2013,262):204-300.

21. 赵秀娟,韩雅楠,蔡禄.氯化钠胁迫下的蒙古黄芪基因组MSAP分析,广东农业科学(核心)2011, 38(8):1-3.

22. 赵秀娟,韩雅楠,蔡禄. NaCl胁迫下的碱蓬基因组MSAP分析,湖北农业科学,2011, 50(18):3856-3858.

23. 赵秀娟,韩雅楠,张超群,蔡禄. 盐胁迫对植物生理生化特性的影响,湖北农业科学,2011, 50(19):3897-3899.

24. 韩雅楠,赵秀娟,蔡禄. MSAP技术在植物抗逆性方面的应用[J].生物技术通报,2010,6:71-74,79.

25. 韩雅楠,赵秀娟,李艳君,蔡禄.高盐方法提取蒙古黄芪基因组DNA的比较分析[J].湖北农业科学,2010,50(3):595-598.

26. 韩雅楠,赵秀娟,蔡禄*.盐胁迫下碱蓬的DNA甲基化测定[A].内蒙古自治区生物信息学研究生学术论坛论文摘要集[C],2010.

27. 韩雅楠,赵秀娟,蔡禄*.盐胁迫对蒙古黄芪DNA甲基的影响[A].中国植物学会植物细胞生物学2010年学术年会[C]2010.

28. 赵秀娟裴智勇刘佳蔡禄,离散量增量结合SVM预测酵母核小体定位,生物物理学报, 2010, 26(5): 421-428

29. 韩雅楠赵秀娟蔡禄. MSAP技术在植物抗逆性方面的应用研究进展.生物技术通报, 2010, 6: 71-74

30. 朱文祥王金荣李珺赵秀娟. 植物组织培养中外植体褐化研究进展. 安徽农业科学, 2010, 38(31):17399-17401.

31. 赵秀娟蔡禄. 基于SVM酵母核小体定位的分类预测.生物物理学报,2009, 25175

32. 蔡禄赵秀娟. 核小体定位研究进展.生物物理学报,2009, 25(6):385-394

会议论文:

1. Yanfei Guo,Yonglin Huang, Miaomiao Zhang, Xiujuan Zhao**, Lu Cai**,Deacetylation of histone H4K5 regulates the expression of metallothionein genes under high concentration of nickel Nickel chloride toxicity in Saccharomyces cerevisiae,表观遗传学与染色质生物学大会, 2019,129北京

2. 赵秀娟,边金,郭燕飞,蔡禄*Transcriptome analysis of Saccharomyces cerevisiae H4K5R under Ni2+ stress,全国生物信息学与系统生物学学生学术大会暨第一届(澳门)生物信息学研讨会,2018.10,澳门

3. 赵秀娟,边金,孟燕燕,陈兴瑶,蔡禄. 镍胁迫下H4K5R酵母菌的转录组分析,科学大数据国际研讨会, 17, 2016, 包头

4. Jin BianXiujuan ZhaoTaotaoXueLu Cai*The role of histone acetylation in the regulation of the initiation of DNA replication in Saccharomyces cerevisiae. 第七届全国生物信息学与系统生物学学术大大会,223,2016,成都

5. 高春艳李珺赵秀娟蔡禄. The RNA binding protein Sam68 enhance exon 7inclusion guring the survival of motor neuron pre-mRNA Splicing. 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会. P176.

6. 李珺高春艳赵秀娟蔡禄. The splicing regulator sam68 binds to a novel exonic splicing silencer and functions in NF1 pre-mRNA. 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会. P184

7. 薛涛涛郑晓东赵秀娟蔡禄. Construction of histone gene mutant of Saccharomyces Cerevisiae. 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会. P212

8. 郑晓东薛涛涛赵秀娟蔡禄. Comparison of ARS element forming nucleosom on Saccharomyces cerevisiae YPH499 III chromosome in vitro. 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会. P319

9. 刘国庆冯芬赵秀娟崔向军蔡禄. Nuclesome organization around pseudogenes in the human genome 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会. P273.

10. Lu Cai, Xiujuan Zhao, ZhiyongPei and Jia Liu. Predicting Nucleosome Positioning based on DNA Sequence, 第四届全国生物信息学与系统生物学大会, 158-160, 2010, 杭州

l 专著与教材

1. 赵宏宇赵秀娟主编,染色质结构与功能(共28.4万字,编写7.2万),2018,哈尔滨,哈尔滨工业大学出版社

2. 马利兵赵秀娟等主编,动物细胞工程(40万字),2011年,吉林,吉林大学出版社

3. 蔡禄赵秀娟等主编,表观遗传学前沿(50万字),2012年,北京,清华大学出版社

l 专利

1. 赵秀娟 蔡禄 边金 郑春丽 赵宏宇. 一株具有镍耐受性的酿酒酵母组蛋白定点突变菌株及其应用(CN201710366706.3)发明专利

l 教学情况

为本科生、研究生讲授过《分子生物学》、《微生物学》、《生物化学》、《分子生物学实验》、《遗传学研究进展》和《分子遗传学》等课程。


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